Los modelos Yamaha V6 de 4,2 litros vienen de serie con dos pares de entradas de agua para una mayor eficiencia de refrigeración. Ubicados en el frente y en ambos lados de la unidad inferior, cada par de captadores opera independientemente uno del otro para proporcionar un flujo de agua adecuado en una amplia variedad de aplicaciones y condiciones.

Todos los fuerabordas Yamaha V6 de 4,2 litros cuentan con un sistema de drenaje del capó probado para drenar fácil y eficientemente el agua que ingresa al capó durante el funcionamiento normal del motor. El aire entrante se dirige a través de un laberinto de conductos que atrapan y drenan el agua antes de que ingrese a la entrada del motor, para una máxima confiabilidad.